बोधगया में महाबोधि मंदिर से उत्तर में, 25 फीट की दूरी पर स्थित जगन्नाथ मंदिर बिहार का प्रसिद्ध धार्मिक स्थल है। मुख्य मंदिर में भगवान श्रीकृष्ण , बलराम व देवी सुभद्रा की भव्य विग्रह मूर्तियां स्थापित हैं। इस मंदिर परिसर में राम - जानकी मंदिर की भी स्थापना की गयी है जो नवनिर्मित है। मंदिर का मुख्य द्वार दक्षिण दिशा में और साथ ही यहाँ एक पीपल का पेड़ देखने को मिलेगा जो काफी समय से मंदिर परिसर में है।
प्राचीन परंपरा के अनुसार, जगन्नाथ मंदिर में हरेक दिन , दोपहर 12 बजे से 2 बजे के बीच , महाप्रसाद का भगवान को भोग के बाद, भक्तों के बीच वितरण होता है। इसमें रविवार से शुक्रवार तक चावल, दाल, सब्जी, पापड़ आदि और शनिवार को खिचड़ी का भोग बनता हैै।प्रत्येक वर्ष, जून-जुलाई के महीने में उडिसा स्थित जगन्नाथपुरी से रथयात्रा के आरंभ के साथ, बोधगया स्थित जगन्नाथ मंदिर से भी रथयात्रा का भव्य आयोजन होता है।